當細胞破碎的時候，蛋白水解酶就會被釋放出來或被激活，使電泳結(jié)果復雜化，影響zui終結(jié)果分析。為了避免這些情況的出現(xiàn)，建議在樣品制備時盡可能在低溫下進行。此外，許多蛋白酶在PH9以上就失活了，因此Tris堿，碳酸鈉或堿性載體兩性電解質(zhì)往往能抑制蛋白水解。但是有些蛋白酶在上述條件下仍然保持著活性，此時應(yīng)當使用蛋白酶抑制劑。因此對于我們想要研究的蛋白來說，選擇性和有效的抑制這些蛋白酶對于蛋白純化路線設(shè)計來說顯得尤為重要。
蛋白酶抑制劑與蛋白酶一樣，都是紛繁復雜的，通常使用許多化學物質(zhì)作為蛋白酶抑制劑，如PMSF和leupeptin。而且由于一種蛋白酶抑制劑只對某一類蛋白酶起作用，因此通常建議復合使用蛋白酶抑制劑，如廣譜蛋白酶抑制劑“雞尾酒”，見下表（來自《蛋白質(zhì)電泳實驗技術(shù)》）。

蛋白酶抑制劑的功能和分類
 蛋白酶功能 :
         涉及到許多細胞內(nèi)和細胞外的過程: 
1 食物蛋白在消化道的消化
2 激活無活性酶原和多肽激素/神經(jīng)轉(zhuǎn)移介質(zhì)的釋放
3 調(diào)節(jié)血凝物質(zhì)和纖維素
4 內(nèi)源性和外源性蛋白的細胞內(nèi)消化
5 跨膜的蛋白轉(zhuǎn)移
6 微生物對生物體攻擊,通過釋放蛋白酶的導致毒性增加
 蛋白酶分類 :
根據(jù)催化中心結(jié)構(gòu)的不同蛋白酶可分為4類 :
 1.   絲氨酸蛋白酶在其活性中心含有絲氨酸和組氨酸，如:  糜蛋白酶,彈性蛋白酶，血纖維蛋白溶酶，凝血酶，枯草桿菌蛋白酶，胰酶Chymotrypsin, Elastase, Plasmin, Subtilisin,Thrombin, Trypsin
 2.   半胱氨酸蛋白酶（別名 :硫醇或SH 蛋白酶）在其催化中心含有半胱氨酸，如 : Calpain, 組織蛋白酶 B,C 和L，和木瓜蛋白酶
 3   天(門)冬氨酸蛋白酶 （羧基蛋白酶）在其活化中心含有天(門)冬氨酸， 如 : 組織蛋白酶D, 木瓜蛋白酶, 腎素
 4.   金屬蛋白酶含有金屬離子， 即 : 鋅2+在其催化中心，如氨基肽酶，羧基蛋白酶A 和 B，嗜熱菌蛋白酶
   在分離蛋白時，組織或細胞裂解液中充滿了來自溶酶體的酶,并且原來無活性的蛋白酶原被充分激火,開始消化其周圍的蛋白質(zhì).為避免此因素，蛋白酶抑制劑必須被加入在緩沖液內(nèi)以阻止蛋白酶對細胞組織的消化作用. 來自哺乳類動物，植物, 霉菌或細菌的組織，蛋白酶成分是不同的,并根據(jù)機體狀態(tài)的發(fā)展蛋白酶也可以發(fā)生變化.  哺乳類動物組織分離時比細菌或其它組織分離時更需要應(yīng)用蛋白酶抑制劑使組織細胞受到*的保護.
 因此，在各種蛋白分離時，在各種蛋白電泳時蛋白酶抑制劑的適當選用就成了很重要的因素。

  羅氏蛋白酶抑制劑&磷酸酶抑制劑
cOmplete 是多種蛋白酶抑制劑的混合片劑：為水溶性片劑；同時持續(xù)抑制絲氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶及金屬蛋白酶等在內(nèi)的多種蛋白酶；可用于所有的組織及細胞，如動物、植物、酵母、細菌或真菌。
PhosSTOP保護蛋白質(zhì)不發(fā)生去磷酸化反應(yīng)；可以抑制多種磷酸（酯）酶；適用于在細胞裂解過程中保護蛋白質(zhì)，并且可以適用于多種不同來源的樣品（哺乳動物，植物，酵母）；可以結(jié)合cOmpleysis Kits 和 cOmplete Protease Inhibitor CocktailTablets一起使用；這種抑制劑藥片可用于緩沖福爾馬林（福爾馬林固定術(shù)）。